Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P63132 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms