Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms