Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIRAP54198 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRAP54198 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRAP54198 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRAP54198 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRAP54198 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRAP54198 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRAP54198 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRAP54198 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRAP54198 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRAP54198 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIRAP54198 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRAP54198 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRAP54198 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRAP54198 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRAP54198 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRAP54198 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRAP54198 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRAP54198 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRAP54198 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRAP54198 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRAP54198 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRAP54198 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRAP54198 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRAP54198 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRAP54198 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRAP54198 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRAP54198 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRAP54198 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRAP54198 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRAP54198 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRAP54198 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIRAP54198 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRAP54198 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRAP54198 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRAP54198 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRAP54198 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRAP54198 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRAP54198 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRAP54198 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRAP54198 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRAP54198 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRAP54198 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRAP54198 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRAP54198 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRAP54198 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRAP54198 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRAP54198 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRAP54198 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRAP54198 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRAP54198 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms