Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms