Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AC009800.1-201ENST00000511357 1006 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AC092130.1-201ENST00000565531 531 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AC139792.1-201ENST00000607051 647 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 LECT2-201ENST00000274507 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 ZRANB2-207ENST00000611683 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 LINC00959-202ENST00000637128 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 DPM1-203ENST00000371588 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 CTHRC1-203ENST00000520337 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AP002495.1-202ENST00000528511 933 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD11P31277 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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