Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms