Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms