Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNB1P20700 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms