Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHCEP18577 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHCEP18577 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHCEP18577 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RHCEP18577 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RHCEP18577 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHCEP18577 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHCEP18577 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHCEP18577 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHCEP18577 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHCEP18577 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHCEP18577 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHCEP18577 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHCEP18577 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHCEP18577 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHCEP18577 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHCEP18577 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHCEP18577 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHCEP18577 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
RHCEP18577 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RHCEP18577 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RHCEP18577 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RHCEP18577 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RHCEP18577 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RHCEP18577 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHCEP18577 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHCEP18577 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHCEP18577 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHCEP18577 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHCEP18577 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHCEP18577 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHCEP18577 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHCEP18577 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHCEP18577 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHCEP18577 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHCEP18577 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms