Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms