Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A1P13866 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms