Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HOXD8P13378 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD8P13378 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms