Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms