Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
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CEP290O15078 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP290O15078 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP290O15078 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP290O15078 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP290O15078 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP290O15078 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP290O15078 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP290O15078 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP290O15078 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP290O15078 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP290O15078 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP290O15078 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP290O15078 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP290O15078 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP290O15078 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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CEP290O15078 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CEP290O15078 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CEP290O15078 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CEP290O15078 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CEP290O15078 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
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CEP290O15078 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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CEP290O15078 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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CEP290O15078 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CEP290O15078 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CEP290O15078 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CEP290O15078 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CEP290O15078 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CEP290O15078 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CEP290O15078 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CEP290O15078 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CEP290O15078 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CEP290O15078 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CEP290O15078 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
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CEP290O15078 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CEP290O15078 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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