Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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