Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC2Q9Y2U9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms