Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM2AQ9Y2K7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms