Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NINLQ9Y2I6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINLQ9Y2I6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms