Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC5Q9UQL6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC5Q9UQL6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms