Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
INO80Q9ULG1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms