Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms