Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMS3Q9UJD0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms