Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP5Q9NZZ3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms