Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms