Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCLQ9NW38 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms