Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms