Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLMQ9NP87 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLMQ9NP87 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms