Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms