Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms