Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms