Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KATNB1Q9BVA0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms