Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms