Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG3Q96JB2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms