Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM54Q969K7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms