Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms