Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC4Q8TBB5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms