Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms