Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD4Q7Z3J3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD4Q7Z3J3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms