Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms