Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XIRP1Q702N8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XIRP1Q702N8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms