Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRIG3Q6UXM1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms