Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC174Q6PII3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms