Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIRMAQ69YN4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms