Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms