Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARFGEF3Q5TH69 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms