Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP28Q4G0W2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP28Q4G0W2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP28Q4G0W2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP28Q4G0W2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms