Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 NUDT4-205ENST00000548662 765 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 AC105430.1-202ENST00000567477 483 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 PQLC2L-206ENST00000468043 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 AC137794.1-201ENST00000509185 914 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 ATOX1-206ENST00000522710 591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 RNF148-201ENST00000434824 1304 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 AC004918.1-201ENST00000467537 770 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
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