Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms