Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD4Q14839 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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