Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPP1R1AQ13522 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms